Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3GL3Q99963 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms