Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RNF5Q99942 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RNF5Q99942 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RNF5Q99942 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RNF5Q99942 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RNF5Q99942 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF5Q99942 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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