Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms