Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MMP19Q99542 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms