Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms