Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2Q96Q42 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms