Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAPPC9Q96Q05 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms