Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms