Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms