Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms