Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms