Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf72Q96LT7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf72Q96LT7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms