Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKNOX2Q96KN3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms