Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
MALSU1Q96EH3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms