Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCTD12Q96CX2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms