Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms