Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKD1Q969G9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms