Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC4Q92889 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms