Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF4BQ92750 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF4BQ92750 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF4BQ92750 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms