Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms