Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIPC3Q8TF64 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms