Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms