Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNPRQ8TBG9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms