Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHX4

SPATA3, Spermatogenesis-associated protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA3Q8NHX4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPATA3Q8NHX4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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