Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms