Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms