Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HJURPQ8NCD3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms