Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG16L2Q8NAA4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms