Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms