Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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TMCO5AQ8N6Q1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TMCO5AQ8N6Q1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TMCO5AQ8N6Q1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TMCO5AQ8N6Q1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TMCO5AQ8N6Q1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TMCO5AQ8N6Q1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TMCO5AQ8N6Q1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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