Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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