Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VWDEQ8N2E2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VWDEQ8N2E2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms