Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms