Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPP1R42Q7Z4L9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R42Q7Z4L9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R42Q7Z4L9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms