Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms