Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms