Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BEND4Q6ZU67 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEND4Q6ZU67 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEND4Q6ZU67 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEND4Q6ZU67 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEND4Q6ZU67 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEND4Q6ZU67 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEND4Q6ZU67 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEND4Q6ZU67 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEND4Q6ZU67 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BEND4Q6ZU67 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms