Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC129Q6ZRS4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms