Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP6Q6ZN66 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms