Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms