Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms