Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf54Q6UWD8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms