Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms