Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6P435 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6P435 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q6P435 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q6P435 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q6P435 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q6P435 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms