Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EDC4Q6P2E9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC4Q6P2E9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms