Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms