Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN12LQ6IEE8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms