Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNS3Q68CZ2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNS3Q68CZ2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms