Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms