Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms